Так, я начебто зрозумів, що у вас сталося.
Ось видача за назвою даного товару
тобто це товар із sku_id=8527 - який ви вважаєте дублем
https://box.lanita-shtor.com.ua/admin/shop/products/10499/edit/а ось видача його складової SKU
що все спрацювало правильно (див. скріншот у вкладенні) - відповідність id=8527 взяло як ціну товару, а 1417 - як рівень цін "Оптова ціна (від одного рулону)"
а цей товар
https://box.lanita-shtor.com.ua/admin/shop/products/6688/edit/ - ну мабуть він раніше був у вас 1, без рівня цін - а потім нібито не до нього додався рівень цін (у такому разі дубль не створило б), а створили новий товар і цей нібито став рівнем цін (у нас додався рівень цін, старі товари не видаляються)
власне що вам потрібно – розібратися що у вас справді дубль, який вже прописаний в іншому товарі як рівень цін – і видалити такий дубль.