Максим, в названии фильтра четко написано что он должен фильтровать. У Вас ошибка либо в названии либо в алгоритме.
Слово "Были " имеет вполне определенное значение. Для Вашей логиги есть другое слово "Перешли"
....которые перешли в выбранные этапы в заданном промежутке времени
Как по мне, лучше сделать как написано в названии, но в крайнем случае исправльте, пожалуйста, название фильтра. Например, KPI
https://crm.ohrana.ua/admin/kpi/90/ фиксирует процессы, которые на определенную дату БЫЛИ на данных этапах. Но отфильтровать эти процессы нельзя из-за того что фильтр работает не так как написано. Спасибо.