Минутный крон у вас работает.
Для того, чтобы он полностью отработал - нужно примерно 10 минут, то есть работает он у вас раз в 7-10 минут. А если вы запускаете, например, рассылку или какие-то массовые действия, или, например, вручную запускаете часовое или дневное действие, которому нужно 20, 30, 40 минут, то на этот период минутный крон тоже "не будет работать". По факту работать он будет, но для того, чтобы выполнить положенные на него действия, ему нужно 40 минут.
Чтобы немного разгрузить его, в действиях, рекомендую поставить подобные настройки
https://prnt.sc/wi4mxq , где это возможно.
А заказы с прома загружаются, вот свежие
https://prnt.sc/wi4q6kОни у вас загружаются в xml файла - если они есть там, то должны быть и в системе.
Платежи за вчерашнюю дату тоже есть
https://prnt.sc/wi4sfp