Крон запускается, но не успевает отработать.
Сегодня крон был запущен руками и отработал, время работы Work time: 19,304.44 s
19,304.44 s = 5,36 часа.
Ночью у крона нет столько времени, т.к. запускается скрипт обновления ПО и "убивает" все запущенные кроны.
Выполнив sudo -s вы повысили себы до рута.
Если вы запускаете что либо в боксе это должно происходить от корректного юзера, т.к. могут быть неожиданные проблемы.
Если же Вы руками запускаете крон, то дождитесь его завершения.
Если которотко:
SWAP (своп) — это механизм виртуальной памяти, при котором часть данных из оперативной памяти (ОЗУ) перемещается на хранение на HDD (жёсткий диск), SSD (твёрдотельный накопитель).
В ОС Linux оперативная память (ОЗУ, RAM, random access memory) делится на разделы, называемые страницами (pages). Swapping (”подкачка”, своппинг) – это процесс во время которого страницы памяти копируются на специально сконфигурированный для этого раздел диска, называемый swap space (раздел подкачки, может быть как и файлом, так и разделом жесткого диска), для освобождения ОЗУ. Совокупные размеры физической памяти и раздела подкачки – это объем имеющийся виртуальной памяти.
Если есть желание вникнуть в суть по глубже, то вот статья, на мой взгляд очень хорошо поясняющая некоторые тонкости работы с памятью в ОС Linux.
https://habr.com/ru/company/flant/blog/348324/