SWAP на сервері практично заповнений

Простыми словами, SWAP - это продолжение оперативной памяти (RAM).
Когда некоторая программа просит разместить данные в оперативной памяти, она делает запрос на выделение "виртуальной памяти" в операционную систему, далее сама операционная система смотрит есть ли свободная оператива или нет. Если есть - выделяет ее, если нет - выделяет место на диске (это есть swap).

То есть, если не хватает физически оперативы - то только тогда начинает использоваться SWAP.
Пока есть свободная оператива (RAM) - swap в 99% случаев не трогается (есть нюансы, но в среднем так).
Если оперативы не было, использовался swap, а потом опертива появилась свободная - операционная система постепенно (не мгновенно), переложит данные в оперативу если они будут нужны.

Скорость работы оперативной памяти DDR4 - грубо 20 гигабит/секунду.
Скорость работы SSD диска - грубо 5 гигабит/скунду.
То есть, SWAP в 4 раза медленнее оперативы.
Если что-то залезет в SWAP - оно начнет работать медленнее.

Почему в swap'e что-то есть, при этом куча свободной оперативы?
Значит была ситуация, когда оперативы не хватило, какие-то данные переложились в swap, затем никто эти данные не запрашивал, вот они там и лежат пока-что.

Вообще механизм SWAP как раз сделан чтобы нивелировать пиковые нагрузки на оперативу.

В вашем случае судя по скриншоту еще куча свободной оперативы, поэтому, беспокоится на стоит.
Если хотите, можно просто перезагрузить сервер (время простоя 5 минут) - и swap автоматически "почистится".

Проблемы начинаются когда RAM забит на 100% и SWAP забит на 100%, вот тогда все, всему хана и надо вмешиваться.